清洗反滲透膜元件的預處理工藝設計是可以很大可能地去除原水中帶來的污染物質，但并不能夠全部去除，所以反滲透元件污染現象很普遍，但大多數污染物質通過定期的化學清洗也是可以被去除得。

1、標準化后的產水量減少10-15％脫鹽率下降0.5％壓差△P上升15％（與初始24-48小時的壓差值對比）。

2、需清洗藥方和其它設備化學清洗藥箱通常是PE或FRP材質，可以耐受PH范圍1-12。

3、清洗加熱裝置的溫度盡量高些，比如20-40℃。化學清洗不要在10℃以下進行，因為清洗效率很低,因此清洗時還需加熱裝置。

4、清洗程序為循環清洗，把濃水的出水管連接到清洗藥箱里。

5、向清洗水箱中注入反滲透膜產品水，清洗藥液要滿足壓力容器和管路體積的需要。

6、將加熱的藥液經泵注入反滲透膜，流量10-15m3/h，揚程20-30米，要符合要求，不要過高。

7、清洗完成后用反滲透膜產水或干凈的水（過濾并SDI＜3，而且不含余氯和微生物，電導值＜10000μs/cm），對膜進行沖洗,沖洗時間為半小時以上。

8、清洗結束后系統重新啟動，但開始的水可能要排放掉直到產水電導和pH值恢復正常。

9、在系統再運行的時候須加阻垢劑,由于該系統前的預處理的電導率很高，超過1000μs/cm，此水質很容易造成反滲透膜的污堵，會使電導率升高，產水量下降，壓力升高等狀態。